Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	35952	36000	49	49 [0]	[0] 60	caiB	crotonobetainyl CoA:carnitine CoA transferase

GGCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAG  >  minE/36001‑36062 |                                                              ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:79899/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:616114/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:632487/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:637991/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:644450/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:650348/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:656813/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:662617/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:68812/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:688700/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:688955/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:732203/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:741107/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:755820/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:760324/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:140458/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:799485/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:831654/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:834177/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:839805/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:840803/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:841603/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:856421/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:885233/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:89957/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:91977/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:921025/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:932321/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:933058/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:559202/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:1032277/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:159976/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:168170/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:168843/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:209307/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:21370/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:239011/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:285438/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:294767/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:320131/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:324134/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:330302/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:340687/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:347398/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:3497/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:356364/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:361428/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:366533/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:366898/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:376496/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:451824/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:45870/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:485975/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:488731/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:507597/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:527116/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:530445/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:607118/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATAACGATGTAg  <  1:894113/62‑1 (MQ=255) ggCCAATATCCTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAg  <  1:939050/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGCCAATATCTTTAAAGCACTCTTCAATTTGGGTAATGCCCACCAGTTCCATCACGATGTAG  >  minE/36001‑36062

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑