Missing coverage evidence...
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TATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGG  >  minE/640244‑640304 |                                                             tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggt  <  1:814301/61‑2 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:802346/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:1006156/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:625865/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:632491/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:658865/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:675990/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:68870/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:700635/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:71063/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:766718/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:783937/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:609591/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:820733/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:868109/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:890020/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:905179/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:941970/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:951562/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:965955/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:993070/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:33675/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:138269/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:143927/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:205002/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:236522/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:242919/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:251848/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:275151/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:294482/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:302811/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:306886/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:609047/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:395055/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:398806/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:443103/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:477043/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:496758/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:532299/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:561076/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:593970/61‑1 (MQ=255) tATGCGCGCAGGGGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCggg  <  1:65821/61‑1 (MQ=255) |                                                             TATGCGCGCAGGTGGTGTAGGATATTATCCACGTAGTAACTTTGTGCATATTGATACCGGG  >  minE/640244‑640304

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑