Missing coverage evidence...
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CACCACATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGAAA  >  minE/663709‑663770 |                                                              cacctcATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:322181/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:726559/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:798534/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:794955/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:780482/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:779601/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:768136/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:760465/62‑1 (MQ=255) caccacATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGaaa  <  1:748033/62‑1 (MQ=255) 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CACCACATCACCAATGCGAATCACTTTCCAGCGATCTTCTTCCCAGGCTGACGCGCCGGAAA  >  minE/663709‑663770

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑