Missing coverage evidence...
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CGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATCGC  >  minE/665124‑665184 |                                                             cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:764315/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:49815/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:514956/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:538716/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:592874/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:605849/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:621069/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:65775/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:679351/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:718980/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:725553/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:735611/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:753797/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:484661/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:798517/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:809268/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:81459/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:820323/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:859795/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:882767/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:888065/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:902967/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:904830/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:945863/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:984224/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:990582/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:291238/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:1035158/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:1035256/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:115622/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:12613/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:130011/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:153042/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:189275/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:243213/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:255967/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:261419/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:270820/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:284557/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:1004348/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:319299/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:350779/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:352706/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:379286/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:391955/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:395083/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:405055/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:432383/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:461398/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:479955/61‑1 (MQ=255) cGATCCGATGTGTGGCTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATcgc  <  1:424107/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGATCCGATGTGTGGTTCCGGTACGTTGCTGATTGAAGCAGCGATGCTGGCGACCGATCGC  >  minE/665124‑665184

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑