Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 689796 689917 122 22 [0] [1] 95 hyaA hydrogenase 1, small subunit

AAACCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCA  >  minE/689916‑689975
  |                                                         
aaaCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:701891/60‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCATGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:907953/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:830296/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:856901/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:829816/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:829302/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:821400/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:795882/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:791494/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:784361/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:74906/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:739026/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:732519/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:725839/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:720410/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:709466/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:687257/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:686038/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:682046/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:673300/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:62737/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:620956/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:61599/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:608944/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:907595/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:99098/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:987430/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:987245/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:981955/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:971000/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:955258/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:950874/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:934685/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:934101/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:919931/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:915589/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:835185/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:899780/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:895399/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:894117/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:889912/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:880316/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:878316/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:877690/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:877230/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:858849/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:606397/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:19832/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:269581/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:260696/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:251879/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:248106/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:246875/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:236102/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:231069/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:230099/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:227035/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:226255/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:225650/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:280453/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:19803/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:195527/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:186045/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:179397/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:178898/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:128614/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:120447/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:1035102/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:102101/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:1017917/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:1012120/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:394155/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:574655/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:560577/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:510230/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:490130/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:47851/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:469371/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:4412/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:440698/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:429273/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:411372/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:395213/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:1006456/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:392170/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:390900/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:377561/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:345423/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:335708/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:316632/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:311342/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:288557/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:281850/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:281506/58‑1 (MQ=255)
  aCCGAACATCAGACAGGCAATGAGGATAAAGAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCa  <  1:807629/58‑1 (MQ=255)
  |                                                         
AAACCGAACATCAGCCAGGCAATGAGGATAAACAGGCATGAGCACTCAGTACGAAACTCA  >  minE/689916‑689975

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: