Missing coverage evidence...
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AGGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGT  >  minE/698907‑698968 |                                                              agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:8286/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:1019801/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:659013/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:659380/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:660412/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:674721/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:684919/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:692000/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:702083/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:734966/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:764059/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:779058/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:794737/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:632938/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:857171/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:866847/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:887640/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:889800/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:893788/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:913330/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:919642/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:923538/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:942036/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:949362/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:986384/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:606455/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:1036631/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:1036934/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:108562/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:139436/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:169804/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:187085/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:237319/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:245344/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:246546/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:275657/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:277298/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:280437/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:332002/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:369913/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:418854/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:450461/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:468939/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:477283/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:501730/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:50804/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:528427/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:551966/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:572457/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:632073/62‑1 (MQ=255) agGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACACACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:798066/62‑1 (MQ=255) agGCGGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGt  <  1:878331/62‑1 (MQ=255) |                                                              AGGCTGGTGCCAACAGAACGCCCCACGACCGCGGCATCACTCACCGCCAGCATCGGCGGCGT  >  minE/698907‑698968

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑