Missing coverage evidence...
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GGCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGA  >  minE/51662‑51723 |                                                              ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCct               >  1:896020/1‑49 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGt         >  1:697173/1‑55 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCata  >  1:522276/1‑60 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCa    >  1:375507/1‑60 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAg   >  1:139916/1‑61 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAg   >  1:3460/1‑61 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAg   >  1:750801/1‑61 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:847484/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:779589/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:770169/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:767225/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:851915/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:897864/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:669676/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:931325/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:655441/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:934018/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:627089/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:563864/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:558041/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:529045/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:147203/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:499025/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:288098/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:150501/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:178222/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:206094/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:216631/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:223928/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:269768/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:285/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:489460/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:329069/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:337113/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:354464/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:384583/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:403/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:427982/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:446402/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGGCGGCAGa  >  1:163814/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGATGGTCGGCAGa  >  1:447508/1‑62 (MQ=255) ggCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCC‑CCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAg   >  1:724901/1‑60 (MQ=255) ggCAACTCATGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGa  >  1:287962/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGCAACTCCTGAATACGGCCCCAGCCCATCTGGCCGCCGTTCAGCGCCTGCTGGTCGGCAGA  >  minE/51662‑51723

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑