Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	769162	769389	228	79 [1]	[0] 40	phoP	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoQ

TATGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCT  >  minE/769390‑769449 |                                                            tatGAAACGGTTTAGTCACATATTCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:585727/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:684474/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:436092/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:453250/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:460444/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:577515/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:585082/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:615880/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:660265/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:681841/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:420142/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:691272/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:74780/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:782265/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:844269/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:846911/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:925989/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:939916/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:959898/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:96227/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:312389/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:1001344/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:1013195/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:1035610/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:139824/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:206198/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:2112/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:227367/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:246272/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:28905/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:1000839/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:360467/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:367464/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:393278/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:393552/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:398878/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:40575/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:407007/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:407176/1‑60 (MQ=255) tatGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCt  >  1:409646/1‑60 (MQ=255) |                                                            TATGAAACGGTTTAGTCACATAATCATCAGCACCGGCACTTAATACTTCGACTTTGTCCT  >  minE/769390‑769449

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑