Missing coverage evidence...
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CTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTA  >  minE/774648‑774708 |                                                             cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:695772/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:499793/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:510832/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:511195/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:517925/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:540054/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:547795/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:559152/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:593980/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:657580/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:678024/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:485811/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:702480/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:70284/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:777410/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:818956/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:843984/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:8833/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:958974/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:987165/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:994617/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:277153/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:1005856/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:109775/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:16046/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:171205/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:183833/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:186609/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:186889/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:193499/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:205919/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:1005116/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:289984/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:311525/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:331294/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:342036/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:445824/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:456344/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:467017/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:481408/61‑1 (MQ=255) cTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGGCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:745531/61‑1 (MQ=255) cTGATTAGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:415207/61‑1 (MQ=255) cTGATACGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTa  <  1:441882/61‑1 (MQ=255) |                                                             CTGATTCGTGAATATCGCGTTGCCATTAAAGGTCCGCTGACCACTCCGGTTGGTGGCGGTA  >  minE/774648‑774708

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑