Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	827091	827215	125	45 [0]	[0] 51	narL	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with NarX (or NarQ)

GCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGA  >  minE/827216‑827277 |                                                              gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACACTGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:203292/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:797576/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:488598/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:52713/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:533806/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:542214/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:561902/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:578031/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:664918/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:673628/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:695927/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:700553/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:727210/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:751869/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:481624/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:800853/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:809246/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:852324/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:870440/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:871808/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:880566/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:90480/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:914708/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:916622/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:926432/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:964778/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:294613/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:1013298/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:1023263/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:173853/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:175530/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:198816/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:205890/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:21011/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:220727/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:22170/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:249831/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:267182/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:275215/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:1011566/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:312385/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:382066/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:386805/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:393100/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:405433/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:427887/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:435136/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:439190/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:446747/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:461715/62‑1 (MQ=255) gCGGTGACCACATCTTCTCCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGa  <  1:732417/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCGGTGACCACATCTTCTTCATGGTTAGAGACGCTGAATACCACAATGCGCCCTGAGAGGGA  >  minE/827216‑827277

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑