Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	58818	58852	35	95 [0]	[0] 44	hepA	RNA polymerase‑associated helicase protein

TCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCA  >  minE/58853‑58913 |                                                             tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:770379/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:426086/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:451080/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:484837/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:509660/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:52404/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:576444/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:620405/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:690405/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:753518/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:76185/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:422085/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:805695/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:806671/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:833986/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:847109/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:892566/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:90071/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:921389/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:922086/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:92616/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:945265/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:319485/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:214149/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:217580/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:226688/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:251104/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:256712/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:266375/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:275002/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:283218/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:302185/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:1036061/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:320671/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:323159/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:362040/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:375639/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:379028/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:386574/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:391629/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:404398/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:174941/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCACCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:313504/61‑1 (MQ=255) tCGCCACCGTTGGAGGGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCa  <  1:420578/61‑1 (MQ=255) |                                                             TCGCCACCGTTGGAGTGGATTTCCAGCAGGCGGTCACGACCCTGTTCCAGCTGTGCTTTCA  >  minE/58853‑58913

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑