Missing coverage evidence...
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GATTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAG  >  minE/855594‑855655 |                                                              gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGTCAGCAAATAg  <  1:162025/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATat  <  1:1005037/62‑2 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:754870/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:473682/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:486206/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:493408/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:56494/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:577529/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:587014/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:595270/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:695160/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:715037/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:444586/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:838100/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:890645/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:894280/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:901048/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:936301/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:944166/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:950530/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:988188/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:261323/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:1005886/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:1006206/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:125230/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:139390/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:155543/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:161327/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:200829/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:233306/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:447211/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:261743/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:265332/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:267451/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:28423/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:286345/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:354969/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:394190/62‑1 (MQ=255) gatTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAg  <  1:401993/62‑1 (MQ=255) |                                                              GATTGAGGGGTAACGCGGCGCGGTTTTCTGCGCCGGTCACGCCTGCTCGTGACAGCAAATAG  >  minE/855594‑855655

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑