Missing coverage evidence...
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GACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGC  >  minE/904353‑904414 |                                                              gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCAt                   >  1:637745/1‑45 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:562236/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:970999/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:959485/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:932646/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:896673/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:885601/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:750774/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:735239/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:709139/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:693779/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:675482/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:660110/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:647552/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:60874/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:563636/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:1000757/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:527596/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:504647/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:496709/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:489726/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:47015/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:441960/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:356227/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:346085/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:341945/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:270568/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:236406/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:160323/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:1029590/1‑62 (MQ=255) gACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGc  >  1:1020056/1‑62 (MQ=255) |                                                              GACCATCAACGCCAGCTTTTACACGGTGTATATGTTCTCTGGCATTTTGCTGGTGGTGCCGC  >  minE/904353‑904414

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑