Missing coverage evidence...
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TGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGT  >  minE/917657‑917718 |                                                              tgCGTGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:748166/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGTAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:1004672/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTccct  <  1:957581/62‑3 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:623422/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:1034877/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:665198/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:678347/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:720578/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:742033/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:751983/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:795001/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:8119/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:847164/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:896230/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:90487/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:909849/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:928050/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:929305/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:950159/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:988829/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:605893/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:1035324/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:1362/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:236581/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:310446/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:313529/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:336172/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:34156/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:347557/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:369577/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:396635/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:430293/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:447011/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:494025/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:522468/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:530001/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:553859/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:605432/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTAGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:831596/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATATGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:841315/62‑1 (MQ=255) tgCGGGTGATTTGCGATACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGt  <  1:607897/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGCGGGTGATTTGCGCTACGCAGAAGAATCTGGTCGAACTGGTGCAAAAAGGCATGTTCCGT  >  minE/917657‑917718

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑