Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1040027	1040302	276	33 [0]	[0] 80	nth/ydgR	DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase/predicted transporter

ATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGA  >  minE/1040303‑1040346 |                                            atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCTAGa  <  1:305665/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:659184/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:789313/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:778673/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:718780/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:70731/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:70202/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:690269/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:676079/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:671734/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:664530/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:527370/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:636858/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:63561/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:629485/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:625594/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:603073/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:584357/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:543110/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:529496/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:509696/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:87865/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:987585/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:962401/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:961985/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:959377/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:936778/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:933698/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:931510/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:920069/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:885654/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:798773/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:875213/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:875044/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:869861/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:861960/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:852675/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:835568/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:817630/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:811040/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:805458/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:191220/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:305638/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:293699/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:275993/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:248886/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:243838/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:23279/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:221102/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:20340/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:195615/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:31054/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:178154/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:172217/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:159955/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:157967/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:118448/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:110288/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:105325/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:1028744/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:1022310/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:40911/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:508629/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:505633/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:485673/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:479731/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:471025/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:452527/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:446416/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:434880/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:433777/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:100386/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:403032/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:383911/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:344074/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:340254/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:338136/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:335692/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:334435/44‑1 (MQ=255) atatGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGa  <  1:331733/44‑1 (MQ=255) |                                            ATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGA  >  minE/1040303‑1040346

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑