Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1125563	1125581	19	71 [0]	[0] 61	pheT	phenylalanine tRNA synthetase, beta subunit

GCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTATT  >  minE/1125582‑1125643 |                                                              gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTact  <  1:524554/62‑3 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:780389/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:5596/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:564592/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:572184/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:607169/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:612549/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:617674/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:626150/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:650052/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:682492/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:68401/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:716200/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:725585/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:765861/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:774198/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:533564/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:785310/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:797114/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:83642/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:871083/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:873719/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:874270/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:887989/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:904391/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:926932/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:932985/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:950892/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:956849/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:97722/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:994804/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:300333/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:1036656/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:123931/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:156397/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:171488/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:17545/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:190462/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:196531/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:209030/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:244999/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:247763/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:255162/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:255794/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:275921/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:298677/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:544049/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:30823/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:30888/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:38861/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:398570/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:414115/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:424580/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:425835/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:436118/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:441149/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:457104/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:480404/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:490700/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:52576/62‑1 (MQ=255) gCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTAtt  <  1:1025727/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCTATCAATCGCCGGGTTCACCCATTCGCGTAACCACAGTTCACTGAATTTCATAATCTATT  >  minE/1125582‑1125643

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑