Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1163254	1163296	43	11 [0]	[0] 40	ynjA	conserved hypothetical protein

TTCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGGCTGGCTG  >  minE/1163297‑1163358 |                                                              ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:79965/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:1005132/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:493160/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:519930/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:520819/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:544471/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:61305/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:650361/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:663158/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:797967/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:458498/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:872272/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:909963/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:918104/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:923897/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:926285/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:936401/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:955399/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:970194/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:992560/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:223303/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:1020765/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:1022022/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:1031372/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:1031538/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:125775/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:137318/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:167920/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:19811/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:453319/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:245614/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:303132/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:307999/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:338972/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:351991/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:388793/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:405104/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:433036/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGCTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:127000/62‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTATTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGgctggctg  <  1:60889/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTCGCTGGTGGGGGCGGATCCCGTTTATCTTTTATCTGGTGTCGATGTTTGTTGGCTGGCTG  >  minE/1163297‑1163358

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑