Missing coverage evidence...
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ACGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCA  >  minE/1167518‑1167579 |                                                              aCGCATATCTCCATCCTGCGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:424964/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGc   >  1:124334/1‑61 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGc   >  1:140790/1‑61 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGc   >  1:361058/1‑61 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:561036/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:992786/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:567549/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:62426/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:660497/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:661642/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:705011/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:745336/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:774476/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:793717/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:795269/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:799490/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:844818/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:850887/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:852509/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:862309/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:959071/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:102330/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:32280/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:125604/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:127731/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:178438/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:233378/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:256427/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:279190/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:297291/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:487338/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:385130/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:385968/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:455528/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:468922/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:46915/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:480191/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGAAAAAACTGCCGCa  >  1:810781/1‑62 (MQ=255) aCGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCAGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:323472/1‑62 (MQ=255) aCGAATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCa  >  1:350578/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACGCATATCTCCATCCTGAGTGACGCGCTAAGCGAACCTTCCCGTCTGCAAAAACTGCCGCA  >  minE/1167518‑1167579

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑