Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1211655	1211657	3	102 [0]	[0] 63	yobF/yebO	hypothetical protein/hypothetical protein

ATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAA  >  minE/1211658‑1211718 |                                                             atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:80835/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:1024558/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:641000/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:650943/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:669401/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:688709/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:716596/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:742016/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:743460/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:745199/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:752217/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:768390/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:775031/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:778098/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:785271/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:598226/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:811252/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:83510/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:839355/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:855269/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:86871/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:870715/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:897523/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:917061/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:936096/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:936342/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:939627/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:954227/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:964661/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:974417/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:310299/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:1032985/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:125181/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:164094/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:168772/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:173954/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:18276/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:221937/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:250758/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:263363/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:26637/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:271774/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:282102/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:30901/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:543315/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:329561/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:53426/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:534227/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:445424/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:44244/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:440990/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:431677/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:413354/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:406391/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:403431/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:359189/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:356017/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:324295/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTa   >  1:208935/1‑60 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTCCTaa  >  1:676125/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTAAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:941481/1‑61 (MQ=255) atatatCATTGTGCTTAACCTAGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:9415/1‑61 (MQ=255) atataaCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTaa  >  1:362322/1‑61 (MQ=255) |                                                             ATATATCATTGTGCTTAACCTTGCCAGTTCAGGCAGATACTTAAACTGGCGTATTTTCTAA  >  minE/1211658‑1211718

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑