Missing coverage evidence...
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CGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAAC  >  minE/1269192‑1269252 |                                                             cGTGATTCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:1023689/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCa        >  1:125495/1‑55 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCaaa   >  1:1025143/1‑60 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCaaa   >  1:630635/1‑60 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:960697/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:1007047/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:85680/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:854485/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:85046/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:82216/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:799449/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:773673/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:718240/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:704171/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:674668/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:629390/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:583607/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:568440/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:525964/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:518877/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:515891/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:460691/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:44760/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:354779/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:340641/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:340082/1‑61 (MQ=255) cGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAac  >  1:163156/1‑61 (MQ=255) |                                                             CGTGATGCCTGTAATGTTATAGCGCCGATACTCCGCACGCAGCGGGCCGTTAGCATCAAAC  >  minE/1269192‑1269252

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑