Missing coverage evidence...
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CCATCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCA  >  minE/1284150‑1284213    |                                                             ccATCGACTATCGC‑‑CCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:946834/62‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTTAGGATGGCa  <  1:720696/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGTGGATGGCa  <  1:374104/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:58669/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:510177/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:610080/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:688646/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:725347/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:778290/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:785776/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:820604/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:832942/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:834054/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:844009/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:910203/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:940160/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:989379/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:531061/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:149574/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:483894/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:477930/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:476220/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:457405/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:448471/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:424522/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:381929/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:338378/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:306748/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:287875/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:258743/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:240205/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCa  <  1:156089/61‑1 (MQ=255)    tCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAAAGGTTGAGGATGGCa  <  1:300100/61‑1 (MQ=255)    |                                                             CCATCGACTATCGCCGCCACCAACACTGATTTAAGTACCTTAAAGGCAACGGTTGAGGATGGCA  >  minE/1284150‑1284213

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑