Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1287719	1287801	83	78 [1]	[0] 54	shiA	shikimate transporter

ACCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTC  >  minE/1287802‑1287863 |                                                              aCCGCGCGCACTTTTCCGTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAAtt   >  1:499205/1‑61 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAAtt   >  1:510755/1‑61 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAAtt   >  1:47322/1‑61 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAAtt   >  1:755306/1‑61 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAAtt   >  1:756929/1‑61 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:764520/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:534919/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:540380/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:548510/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:570596/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:571484/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:632679/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:667030/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:700488/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:727131/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:512904/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:765676/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:776913/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:78330/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:785044/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:806686/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:822207/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:832797/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:857064/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:8820/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:899605/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:949239/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:953913/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:986327/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:333027/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:130717/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:150635/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:164048/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:170099/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:171432/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:196148/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:213579/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:222431/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:236420/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:260530/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:272066/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:277412/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:52429/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:344209/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:360998/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:403529/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:420387/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:435255/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:450710/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:482913/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:490869/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:505460/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTc  >  1:1028462/1‑62 (MQ=255) aCCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTACGTAGAtt                   >  1:471207/1‑45 (MQ=38) |                                                              ACCGCGCGAACTTTTCCTTAATATTGGTTTGCTGGTAGGTGGATTAAGCTGCCTGACAATTC  >  minE/1287802‑1287863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑