Missing coverage evidence...
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TATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAAGGA  >  minE/1295366‑1295427 |                                                              tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:854072/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:512005/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:545811/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:572607/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:610504/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:688688/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:697166/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:794886/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:811851/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:1033496/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:858839/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:919002/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:921943/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:948299/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:964659/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:974042/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:980738/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:474158/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:4726/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:467855/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:424454/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:394438/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:388733/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:294877/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:280860/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:233189/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:207389/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:184498/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:145756/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:132023/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:111622/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:1003720/62‑1 (MQ=255) tATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGGCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAagga  <  1:490356/62‑1 (MQ=255) |                                                              TATGATAGATTCGTCATTTGCTCCTTTAATCAGCTGTCGCGTTCCCCTGCCCTATAAAAGGA  >  minE/1295366‑1295427

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑