Missing coverage evidence...
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CAGCAGGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATG  >  minE/1376087‑1376147 |                                                             cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:549307/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:969010/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:902551/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:849412/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:824505/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:772000/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:760318/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:718355/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:62461/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:581136/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:1014825/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:546231/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:524861/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:437067/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:421332/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:401563/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:372418/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:32027/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:1033079/61‑1 (MQ=255) cagcagGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATg  <  1:1028572/61‑1 (MQ=255) |                                                             CAGCAGGTTCAGGCCGACGTTGACACCAGATACTTTTGCCGCTTCCGGGTTACCGCCAATG  >  minE/1376087‑1376147

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑