Missing coverage evidence...
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GTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAT  >  minE/1402902‑1402963 |                                                              gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATcgt  <  1:912853/62‑3 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:849697/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:660381/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:661910/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:668069/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:68216/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:683741/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:687010/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:727922/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:740533/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:8304/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:836022/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:646445/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:853060/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:860749/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:902876/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:95159/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:962778/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:966801/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:98004/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:998557/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:490614/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:147563/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:154774/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:171150/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:239734/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:255358/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:277277/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:282355/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:349936/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:432488/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:1033184/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:495597/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:50165/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:504184/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:545159/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:581238/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:611245/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:613513/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:613811/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:623948/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:627850/62‑1 (MQ=255) gTCGTTGGCCTGCGCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGTGCCCCGGCAGAGAAATCAt  <  1:990249/62‑1 (MQ=255) |                                                              GTCGTTGGCCTGCTCTGCTATTACCTGATGAGCGTACGTATGCGCCCCGGCAGAGAAATCAT  >  minE/1402902‑1402963

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑