Missing coverage evidence...
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TGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCTGGT  >  minE/1408954‑1409015 |                                                              tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCCCCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:594839/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:856831/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:620695/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:643459/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:651596/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:713044/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:728064/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:743761/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:810583/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:833248/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:834569/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:615981/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:882147/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:885269/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:891813/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:943094/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:951769/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:968266/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:978367/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:98258/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:989676/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:345188/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:1011375/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:1017866/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:1024480/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:102718/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:196954/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:217272/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:229364/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:254730/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:265298/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:101032/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:34620/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:410629/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:455215/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:503238/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:513809/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:546355/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:581613/62‑1 (MQ=255) tGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCtggt  <  1:599430/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGATGCATGAAGTGGGATTAGATCCTGAAACACGCCACCGTTATCCGGCGGAGTTCTCTGGT  >  minE/1408954‑1409015

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑