Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1429115	1429133	19	80 [0]	[0] 81	napA	nitrate reductase, periplasmic, large subunit

TGCAGGTTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCG  >  minE/1429134‑1429194 |                                                             tgcaggtTGTAGCCCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:858276/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGCCCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:861104/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACCCGCCACGAGTATGc                  >  1:227991/1‑45 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:726292/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:779298/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:775286/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:774883/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:773935/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:757285/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:752905/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:751630/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:742166/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:812363/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:720343/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:69633/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:690817/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:686823/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:657742/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:651098/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:637088/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:613734/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:612053/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:900387/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:987286/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:986148/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:985518/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:979851/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:970177/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:952426/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:932457/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:928347/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:907418/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:781504/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:899689/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:886689/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:865992/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:853736/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:847876/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:826449/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:575749/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:793071/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:266069/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:611364/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:361296/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:348275/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:33745/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:317783/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:3171/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:310693/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:295149/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:294319/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:380742/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:262394/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:230670/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:228943/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:184003/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:180327/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:177816/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:135404/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:111754/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:108774/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:500544/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:1002114/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:560201/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:554395/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:551492/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:535800/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:520113/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:502226/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:501458/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:397543/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:464459/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:457559/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:445299/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:432393/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:423444/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:419257/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:418743/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:417671/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCg  >  1:401720/1‑61 (MQ=255) tgcaggtTGTAGACCAGCTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCAt    >  1:246965/1‑59 (MQ=255) |                                                             TGCAGGTTGTAGACCAGGTTGTTAGCCCACACGCCACGAGTATGCTGGTTGAAGCCCATCG  >  minE/1429134‑1429194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑