Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1448283	1448296	14	111 [0]	[0] 35	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

CGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCA  >  minE/1448297‑1448358 |                                                              cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:758142/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:603479/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:613942/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:616495/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:658113/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:665995/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:668832/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:691203/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:711957/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:581412/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:772733/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:798269/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:810797/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:850079/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:919215/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:947026/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:982068/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:982239/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:261762/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:169078/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:178170/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:189941/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:193196/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:21191/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:213825/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:239921/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:244563/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:1002662/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:279918/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:355982/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:379916/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:418456/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:538740/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:557691/62‑1 (MQ=255) cGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCa  <  1:558168/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGATTACCACAATTGCCCGGTGAAATGGGGCAAATCAGTCAGAGTGTTAATAACCTCGCCCA  >  minE/1448297‑1448358

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑