Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1448364	1448489	126	20 [0]	[0] 53	atoS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

GCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCC  >  minE/1448490‑1448550 |                                                             gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:718642/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:570942/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:577506/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:577980/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:582283/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:616158/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:62582/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:64063/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:656644/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:6684/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:683119/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:706230/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:707361/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:712127/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:535361/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:743726/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:745568/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:756210/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:75976/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:784010/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:798240/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:838973/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:845866/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:875160/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:878753/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:884722/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:951510/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:351018/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:156099/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:164200/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:189538/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:190489/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:215402/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:243368/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:260610/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:267368/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:271130/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:294366/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:297047/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:108402/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:355168/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:367974/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:376104/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:393555/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:415626/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:42150/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:423184/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:482960/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:519697/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTcc  >  1:533161/1‑61 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTc   >  1:351282/1‑60 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTc   >  1:421982/1‑60 (MQ=255) gCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGATCTACAGTcc  >  1:346407/1‑61 (MQ=255) |                                                             GCCATGAACTGGTAGGGCAGCCTTACTCCATGTTGTTCGACAATACTCAGTTCTACAGTCC  >  minE/1448490‑1448550

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑