Missing coverage evidence...
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GCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCCGC  >  minE/1492764‑1492825 |                                                              gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGcc          >  1:205375/1‑54 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:828584/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:564379/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:569601/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:609609/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:656152/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:67807/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:685167/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:742919/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:755022/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:517413/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:863925/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:904027/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:907015/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:910607/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:981714/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:992639/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:369471/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:196897/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:219904/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:224103/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:23377/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:262691/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:337510/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:192926/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:398376/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:411143/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:423300/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:470865/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:482449/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcgc  >  1:51582/1‑62 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcg   >  1:360491/1‑61 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcg   >  1:359305/1‑61 (MQ=255) gCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCcg   >  1:564766/1‑61 (MQ=255) |                                                              GCCAGTTCCTGCTCGGCTTCCGGCTGGTCAAACGGGTGACGGTGACATACCGCCACGCCCGC  >  minE/1492764‑1492825

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑