Missing coverage evidence...
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GGGTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCA  >  minE/1500649‑1500709 |                                                             gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:351579/1‑60 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:554173/1‑60 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:598692/1‑60 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:161268/1‑60 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:1037464/1‑60 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:1004624/1‑60 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:675919/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:557359/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:568495/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:57716/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:58984/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:594531/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:608095/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:664476/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:670178/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:674550/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:856349/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:72111/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:98418/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:733790/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:769001/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:77096/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:783957/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:815075/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:831863/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:850873/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:879002/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:369888/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:107100/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:107182/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:128017/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:241828/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:261341/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:261600/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:321826/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:331179/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:348629/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:355230/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:546955/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:387224/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:388109/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:429211/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:429784/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:435628/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:435712/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:476061/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:480827/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:48707/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCa  >  1:543209/1‑61 (MQ=255) gggTTCATACGCTCGCGGCGTGAACCCGCGGGCGTCCAGTCAAGCGCGCCAATACGCAcc   >  1:232541/1‑60 (MQ=255) |                                                             GGGTTCATACGCTCGCGGCGTGAACGCGCGGGCGTCCAGTCCAGCGCGCCAATACGCACCA  >  minE/1500649‑1500709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑