Missing coverage evidence...
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TAGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACCTC  >  minE/1506058‑1506120  |                                                              tAGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGAGGGTGATGCTTCACTCACct   <  1:546312/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:462486/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:965303/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:940659/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:924626/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:904729/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:878084/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:84394/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:754233/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:698297/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:672820/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:655824/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:655504/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:609722/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:555407/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:513326/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:1038103/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:38317/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:31718/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:30911/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:299657/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:248446/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:226753/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:215821/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:200371/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:187365/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:170521/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:166946/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:143492/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:12732/62‑1 (MQ=255)  aGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCGGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACctc  <  1:433298/62‑1 (MQ=255)  |                                                              TAGCACCAGACAGAAAATGGCATGGGGTGCCTGGCTGTGCGCGGGTGATGCTTCACTCACCTC  >  minE/1506058‑1506120

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑