Missing coverage evidence...
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TTGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGC  >  minE/1511343‑1511404 |                                                              ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCCGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:688131/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCtgtg           >  1:535408/1‑53 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:715226/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:547527/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:584237/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:600310/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:605471/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:609936/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:643466/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:69131/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:497803/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:783644/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:794091/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:802437/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:803165/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:805180/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:823666/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:85360/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:869705/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:964013/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:254715/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:101108/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:143839/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:154258/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:159770/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:194246/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:211758/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:216210/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:251099/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:1001246/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:292311/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:306382/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:356512/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:367537/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:387595/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:424645/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:472644/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGc  >  1:480313/1‑62 (MQ=255) ttGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCACTGTGCCGTGGAGc  >  1:160751/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGATCCGGCGAAGCTGCAAGAATCCAGCCCGCTGCCGGTTCTCGGCGCTGTGCCGTGGAGC  >  minE/1511343‑1511404

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑