Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1520514 1521144 631 41 [0] [0] 40 [truA]–[usg] [truA],[usg]

GAGCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCGG  >  minE/1521145‑1521187
|                                          
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATAcctg  <  1:815324/43‑3 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgt  <  1:476489/43‑2 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:715108/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:1004489/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:457249/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:462772/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:464297/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:580134/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:626401/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:699344/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:702361/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:432037/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:727513/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:728508/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:78036/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:814355/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:899234/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:93129/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:976972/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:979872/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:316271/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:146804/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:188403/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:239920/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:240019/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:262917/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:271142/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:292677/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:3122/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:421451/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:337710/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:338906/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:346595/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:360621/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:361672/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:363472/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:368441/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:37369/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:376289/43‑1 (MQ=255)
gagCTTCAAAGTTCACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCgg  <  1:940733/43‑1 (MQ=255)
|                                          
GAGCTTCAAAGTTGACCATCTGGGCATGACCGTAGAATACCGG  >  minE/1521145‑1521187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: