Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1523333	1523653	321	61 [0]	[0] 38	flk	predicted flagella assembly protein

TCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATGCG  >  minE/1523654‑1523714 |                                                             tCCGCAACCACATCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:436248/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGATGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:495179/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCt                          >  1:283063/1‑37 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACcggcg              >  1:353705/1‑49 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACcg                 >  1:665562/1‑46 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACaa      >  1:51750/1‑57 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:734104/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:620177/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:646059/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:663428/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:66960/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:690316/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:716502/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:514528/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:755226/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:769337/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:771718/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:800464/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:831881/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:861456/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:907080/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:918527/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:523162/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:1015218/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:505550/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:476070/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:470363/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:457971/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:449647/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:407785/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:300575/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:274277/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:271678/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:186195/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:150826/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:135379/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgcg  >  1:1027992/1‑61 (MQ=255) tCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATgc   >  1:318677/1‑60 (MQ=255) |                                                             TCCGCAACCACAGCAGCGCGAGGCGACCGACCGTCCTTTATTACCGGCGGAGCACAATGCG  >  minE/1523654‑1523714

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑