Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1539835	1540140	306	14 [0]	[1] 88	yfcU	predicted export usher protein

ACGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAG  >  minE/1540140‑1540202  |                                                              aCGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTA‑AACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:294462/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCat  <  1:11118/62‑2 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:634857/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:773512/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:771088/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:762425/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:760200/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:724465/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:716974/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:698993/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:682304/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:681336/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:637667/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:779758/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:620635/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:614445/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:609483/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:608647/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:599013/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:593393/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:585393/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:56873/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:56504/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:893926/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:998101/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:99573/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:993210/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:984902/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:971640/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:969289/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:962487/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:933867/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:908459/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:897312/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:551277/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:861259/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:85930/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:85033/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:848989/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:835243/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:801605/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:800781/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:796908/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:786270/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:223414/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:1003238/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:283829/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:281094/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:275519/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:274349/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:270580/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:262668/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:243392/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:235286/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:226322/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:29210/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:206743/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:189205/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:184858/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:182844/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:172267/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:108078/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:10469/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:1029692/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:1022189/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:1011602/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:401254/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:531062/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:523153/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:500264/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:496336/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:485246/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:469450/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:43709/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:428897/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:29733/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:397868/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:397443/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:3925/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:380421/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:549169/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:348836/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:346977/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:31149/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAg  <  1:300111/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACACTGCCAg  <  1:405492/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCCGACATTGCCAg  <  1:560122/62‑1 (MQ=255)  cGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCATGACATTGCCAg  <  1:834505/62‑1 (MQ=255)  |                                                              ACGGGAATCAAACTGAATGTCGTCTTCAGCCCAGACACTGCTATAACTCCCTGACATTGCCAG  >  minE/1540140‑1540202

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑