Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1541344	1541427	84	36 [0]	[0] 75	yfcV/sixA	predicted fimbrial‑like adhesin protein/phosphohistidine phosphatase

CGCGCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATGG  >  minE/1541428‑1541481 |                                                      cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAATGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:333544/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:63515/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:759089/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:745539/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:719307/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:698414/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:694644/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:689155/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:68138/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:679115/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:774220/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:629512/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:615838/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:605235/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:574832/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:537771/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:526959/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:523109/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:492818/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:917902/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:995693/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:992585/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:968994/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:95450/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:949329/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:945814/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:941678/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:929752/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:927046/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:456861/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:910921/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:898621/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:887268/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:883513/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:867911/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:864531/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:861605/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:852681/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:181590/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:254582/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:249208/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:239809/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:23729/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:230733/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:212512/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:21092/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:205211/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:191568/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:254693/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:157175/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:152656/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:143959/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:140904/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:129997/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:124/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:106215/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:1022147/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:353763/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:1013071/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:43339/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:408514/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:403658/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:385370/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:377809/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:369028/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:362609/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:470060/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:351369/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:310014/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:309236/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:292705/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:290181/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:281837/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:28002/54‑1 (MQ=255) cgcgCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATgg  <  1:267803/54‑1 (MQ=255) |                                                      CGCGCAGAAGAATACTTTCCGAATGAAAGTTAAAGGTGTTTTATTTATAGATGG  >  minE/1541428‑1541481

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑