Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1558699	1559224	526	35 [0]	[0] 63	[emrK]	[emrK]

CATTTATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGATTTT  >  minE/1559225‑1559286 |                                                              catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCt          >  1:155550/1‑54 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:687131/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:795102/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:783585/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:759354/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:752756/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:74757/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:732956/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:707829/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:702535/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:820857/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:678186/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:66457/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:663076/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:654230/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:651197/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:63853/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:635984/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:821612/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:827416/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:831347/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:841606/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:868943/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:88917/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:894201/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:899233/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:905986/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:907314/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:911396/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:9352/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:953812/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:990218/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:371022/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:109107/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:123705/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:160916/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:16226/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:167063/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:188603/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:201279/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:225445/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:22672/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:286684/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:300003/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:330191/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:337991/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:345812/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:350848/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:637717/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:387229/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:405346/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:422707/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:446381/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:456586/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:480563/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:511477/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:514364/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:543779/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:579769/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:5827/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:620360/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAtttt  >  1:1023730/1‑62 (MQ=255) catttATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGAttt   >  1:512017/1‑61 (MQ=255) |                                                              CATTTATGCCGACTATTTATATGGTATACTTGTCGAATTATCTTAAAGGAAGCTCAGATTTT  >  minE/1559225‑1559286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑