Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1560468	1561130	663	25 [0]	[0] 57	evgS	hybrid sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with EvgA

TTATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACA  >  minE/1561131‑1561191 |                                                             ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGGAAAAAGCGCCTGACa  <  1:830196/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:88409/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:1033761/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:64907/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:658755/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:661477/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:663709/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:683518/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:730355/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:735308/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:766464/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:781549/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:795045/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:873788/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:64370/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:900546/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:90271/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:908928/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:936163/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:936202/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:939342/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:960860/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:960994/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:9627/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:964116/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:983032/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:990015/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:425159/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:126528/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:142168/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:161946/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:216499/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:217987/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:245281/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:248060/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:282529/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:318713/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:34366/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:38629/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:397501/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:405812/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:638834/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:459675/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:469490/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:504122/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:508877/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:510692/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:513032/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:544411/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:549448/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:562881/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:578064/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:59136/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:631644/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCTGAAGCCTACATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:854272/61‑1 (MQ=255) ttATTTGCAGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:68638/61‑1 (MQ=255) ttATTCGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACa  <  1:965150/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTATTTGCTGAAGCCTTCATAACAACGCCTTACGTTTTTGTCATGCAAAAAGCGCCTGACA  >  minE/1561131‑1561191

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑