Missing coverage evidence...
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TACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATACTGT  >  minE/136819‑136880 |                                                              tACTAATGTAGCGGTACAAGTACTCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:894857/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:746501/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:980820/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:88942/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:852787/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:820883/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:764282/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:750850/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:1000843/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:53721/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:503157/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:496925/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:355694/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:332627/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:129297/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:1033403/62‑1 (MQ=255) tACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAAAAACGGTCAGTCCAATActgt  <  1:818213/62‑1 (MQ=255) |                                                              TACTAATGTAGCGGTACAAGTACCCATTTCTACAGTAGTAATAACGGTCAGTCCAATACTGT  >  minE/136819‑136880

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑