Missing coverage evidence...
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AAAGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGC  >  minE/1720193‑1720255  |                                                              aaaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTg   <  1:637751/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCTCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:694083/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCTATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTgg  <  1:612143/62‑2 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:82968/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:683266/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:746992/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:759028/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:771440/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:813301/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:825193/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:643754/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:851121/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:873223/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:900012/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:918240/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:931769/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:933067/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:946454/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:961665/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:288701/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:139343/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:156915/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:174608/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:195059/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:195966/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:240751/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:264912/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:27794/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:66157/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:429134/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:490749/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:536614/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:539063/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:591452/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:632529/62‑1 (MQ=255)  aaGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGc  <  1:124908/62‑1 (MQ=255)  |                                                              AAAGCAGTTTATAAAATTCTGTCCGGTTGCGCCCCGCCATTCTCGCCGCGTGGGTGACGTTGC  >  minE/1720193‑1720255

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑