Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1772095	1772159	65	90 [0]	[0] 45	tyrA	fused chorismate mutase T and prephenate dehydrogenase

ATCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATT  >  minE/1772160‑1772221 |                                                              aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCTACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:757345/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:889618/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:747473/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:762238/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:77518/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:795961/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:801480/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:808544/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:816417/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:825956/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:874523/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:880258/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:735399/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:891096/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:891272/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:929074/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:935881/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:941939/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:947170/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:95180/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:961582/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:967328/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:98097/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:61796/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:1035494/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:131922/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:171470/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:179114/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:233737/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:261297/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:262305/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:318897/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:404232/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:437079/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:461479/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:481455/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:510243/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:513685/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:561033/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:570207/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:575507/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:583997/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:588851/62‑1 (MQ=255) aTCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:1010095/62‑1 (MQ=255) aTCGGGGGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCAtt  <  1:102902/62‑1 (MQ=255) |                                                              ATCGGGTGTAGCCCCAGCACCGGACCATCATGCGCCACCAGCATGGCCTGTAATGGCCCATT  >  minE/1772160‑1772221

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑