Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1777407	1777434	28	62 [0]	[0] 47	trmD	tRNA (guanine‑1‑)‑methyltransferase

CAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAT  >  minE/1777435‑1777496 |                                                              cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:795362/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:548515/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:556461/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:565078/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:57130/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:589599/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:611455/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:617395/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:687003/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:726156/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:732522/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:740539/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:542511/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:805271/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:826070/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:84118/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:856296/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:885765/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:885939/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:895431/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:908116/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:909410/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:929140/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:943586/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:409826/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:1021719/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:1027945/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:109056/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:136826/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:158214/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:227292/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:267544/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:308488/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:324754/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:325246/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:331912/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:1017945/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:422955/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:429906/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:434225/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:460196/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:4615/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:472101/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:484158/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:495123/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:498884/62‑1 (MQ=255) cAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAt  <  1:526443/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGTAACACTGGCGGAACTTCCATCCCTTCTAACACCTCAGGCCGCGTATAGTGCGGGCAAT  >  minE/1777435‑1777496

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑