Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1778238	1779369	1132	3 [0]	[1] 55	[rimM]–[ffh]	[rimM],rpsP,[ffh]

TTTATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAT  >  minE/1779369‑1779431  |                                                              tttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTT‑CCCAt  <  1:371714/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTGTCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:511273/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:782642/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:509925/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:514399/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:529643/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:611190/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:666920/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:677433/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:678625/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:718380/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:731254/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:750682/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:750889/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:467569/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:814600/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:817296/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:820711/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:824394/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:86686/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:867631/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:900244/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:91287/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:91872/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:934218/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:946513/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:950945/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:967587/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:309064/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:1006563/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:1013999/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:1016662/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:1017705/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:120914/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:12701/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:134390/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:141210/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:190880/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:202985/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:220244/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:262832/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:297180/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:352388/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:357519/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:378011/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:381770/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:404464/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:425477/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:436127/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:443489/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:458113/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:465506/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:1005842/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCACATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:489798/62‑1 (MQ=255)  ttATCGTCCAACTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAt  <  1:371757/62‑1 (MQ=255)  |                                                              TTTATCGTCCATCTGTGACTTGACGTTATCCGGGATCTGCCCCATGCCCGGCAGCTTGCCCAT  >  minE/1779369‑1779431

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑