Missing coverage evidence...
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TGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCG  >  minE/1793158‑1793219 |                                                              tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTg              >  1:72426/1‑50 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTg              >  1:449352/1‑50 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATc   >  1:258969/1‑61 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATc   >  1:335805/1‑61 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATc   >  1:360368/1‑61 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:396792/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:984065/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:96890/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:78160/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:710182/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:67521/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:649246/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:512338/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:488710/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:452464/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:1001759/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:364737/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:331559/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:308800/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:223026/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:173992/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:165895/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:125766/1‑62 (MQ=255) tGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCg  >  1:1007234/1‑62 (MQ=255) |                                                              TGAGTTAGGCGGCGGGCTGAAGTCACGCCACGTCACCATGTTGTCTATTGCCGGTGTTATCG  >  minE/1793158‑1793219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑