Missing coverage evidence...
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TCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGTGTG  >  minE/1794613‑1794674 |                                                              tCGTTAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAgtg    >  1:409104/1‑60 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGGCGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:704257/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACg                       >  1:853667/1‑41 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAgtgt   >  1:579027/1‑61 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAgtgt   >  1:144425/1‑61 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:775419/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:484512/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:522774/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:697099/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:730645/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:774824/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:413295/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:802650/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:83742/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:872250/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:939208/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:955526/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:956568/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:444255/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:100273/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:377968/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:294268/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:279435/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:273564/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:267255/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:246984/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:15886/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:144120/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:138272/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:136554/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:118761/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:1030848/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGAATGTGCGTCCGAACAGtgtg  >  1:141669/1‑62 (MQ=255) tCGATAAAGACCGCAAGGCCGTTGACGCCTTTATAGCGACGCa                     >  1:302024/1‑43 (MQ=255) |                                                              TCGATAAAGACCGCCAGGCCGTTGACGCCTTTATTGCGACGCATGTGCGTCCGAACAGTGTG  >  minE/1794613‑1794674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑