Missing coverage evidence...
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TCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCG  >  minE/1802041‑1802101 |                                                             tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCa                 >  1:305769/1‑46 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAg    >  1:583473/1‑59 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGc   >  1:601410/1‑60 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGc   >  1:598453/1‑60 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGc   >  1:908351/1‑60 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGc   >  1:490168/1‑60 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:830681/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:60698/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:623158/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:665020/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:666620/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:708226/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:780955/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:982250/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:856587/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:871862/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:908999/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:911784/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:95044/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:954770/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:95940/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:1038106/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:554815/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:531749/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:495200/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:471656/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:456670/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:45126/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:422843/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:422272/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:418422/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:413729/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:348933/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:32320/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:310402/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:254906/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCg  >  1:14244/1‑61 (MQ=255) tCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTAGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATGAGCg  >  1:473876/1‑61 (MQ=255) |                                                             TCAGAAACCCACCTCAACTACCCACAGTTGTTGGGTTCCGTTTTCAGTATGTTTATCAGCG  >  minE/1802041‑1802101

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑