Missing coverage evidence...
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TGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGC  >  minE/1806819‑1806879 |                                                             tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTTTGGATTTTTGCGCGTCGGCCTg    >  1:155956/1‑59 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCgg        >  1:292632/1‑55 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTgg   >  1:615024/1‑60 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTgg   >  1:152591/1‑60 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTg    >  1:395386/1‑59 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:895296/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:726592/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:728131/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:74689/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:756636/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:767488/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:83936/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:855430/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:590232/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:913404/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:947370/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:959928/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:96182/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:963403/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:973579/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:980772/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:990753/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:713145/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:1006638/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:56837/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:567546/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:451919/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:403313/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:349830/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:263903/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:183875/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:180139/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:173371/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:141812/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:138588/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:136039/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:1023699/1‑61 (MQ=255) tGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGc  >  1:102206/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGCTTCTACTGGCGTGCCTATACCTTTGAACCAGGTATGGATTTTGGCGCGTCGGCCTGGC  >  minE/1806819‑1806879

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑