Missing coverage evidence...
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CGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAT  >  minE/146328‑146388 |                                                             cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:815352/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:555291/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:556476/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:614393/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:628201/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:646112/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:703790/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:74677/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:76466/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:544361/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:850828/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:857872/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:894462/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:896684/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:899830/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:947715/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:951195/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:984960/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:300727/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:1025706/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:1028077/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:106157/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:116508/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:186316/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:201800/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:242387/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:291528/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:1019355/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:324817/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:336888/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:360768/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:369665/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:509249/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:521765/61‑1 (MQ=255) cGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAt  <  1:53207/61‑1 (MQ=255) |                                                             CGCATACGACCAGTTAAAACCTGGCGGCGGGATTGTCACCGCCTCGCTGGCGTCGCGCAAT  >  minE/146328‑146388

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑