Missing coverage evidence...
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GGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGG  >  minE/1810935‑1810986 |                                                    ggTTGCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:559154/1‑51 (MQ=16) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGaa                 >  1:429271/1‑37 (MQ=255) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCt              >  1:259811/1‑40 (MQ=255) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCgg  >  1:1033207/1‑52 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:70758/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:175672/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:605225/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:623177/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:624868/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:637561/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:656723/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:658718/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:687221/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:579891/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:828176/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:83302/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:845008/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:862209/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:866963/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:92189/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:943255/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:952520/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:419970/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:181758/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:201749/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:2557/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:137846/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:296873/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:340863/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:359997/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:378462/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:567121/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:109157/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:434554/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:436269/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:489906/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:507094/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:537545/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:558099/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:1017665/1‑51 (MQ=40) ggTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGACGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:677844/1‑51 (MQ=255) ggTTACGGAGAATATAGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCg   >  1:747729/1‑51 (MQ=255) |                                                    GGTTACGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGG  >  minE/1810935‑1810986

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑